建筑企业的工程项目遍布全国各地，通常情况下，建筑企业会在项目所在地设立项目部，作为其派出机构负责工程项目的具体施工组织及管理。在有投标需求的情况下，建筑企业会在项目所在地设立法人单位，以争取地方的工程项目。大型建筑企业集团一般拥有数量众多的子、分公司及项目机构，管理上呈现多个层级，涉及的管理单位自下而上包括一级母公司、二级子(分)公司、三级子(分)公司、项目部等，部分三级子(分)公司下设有四级、五级子(分)公司。                   

    由于承接工程项目的主体多为二级子(分)公司，而实际进行工程施工的单位一般为三级子(分)公司，因此，建筑企业集团内普遍存在内部层层分包的情况。相比营业税下的税收征管，增值税具有“征管严格、以票控税、链条抵扣”的特点，对于每个增值环节均需严格按照销项税额相抵的规定征收增值税，对建筑企业集团多级法人、内部层层分包的组织构架及管理模式提出了挑战，一般情况下，管理链条越长，流转环节越多，潜在的税务风险就越大，甚至造成工程项目的增值税进销项税额不匹配，从而多交增值税，但这一特点一也有利于集团内部实行专业化管理。