(一)对税务管理的整体框架把控不到位

    目前依旧有一些中小企业对税务管理的认识不够深人，缺乏全面性，主要精力依旧是集中在怎样降低税负和税款，所以也往往是从具体的经营业务活动出发，从账务人手，比较善于从微观的角度来把控税务管理工作，但是却没有将其与企业的长远战略规划相融合，也就是说在创立企业的初期，在交易结构和业务模式等宏观层面上面缺乏对税务管理的高效把控，这才是导致中小企业税务管理问题的根源。对中小企业来说，其交易结构和业务模式等相关因素都会对企业整体的税负水平产生直接影响，所以企业在建立的初期，就需要谨慎选择企业的地点，选择正确的科学的与自身发展需求相符合的运营方式和管理模式，并对购销结算模式以及研发投人等与税负息息相关的环节和流程予以全面把控，要从中小企业的交易结构、业务模式等整个流程与环节来对税务管理工作予以全面考量。从某种层面上来看，中小企业交易结构和业务模式只有确立了下来，也才能对企业真实的税负情况加以宏观层面的把控，这会对企业的长远和稳健发展产生不小的影响。可是事实上许多中小企业在对税务管理宏观把控方面的能力比较欠缺，导致出现了或多或少的税务管理问题，加大了税务风险。                 

    (二)缺乏对国家税收法规政策的全面解读

    随着国家对税收政策的优化和调整，一系列减税降赋政策的颁布和执行，在激发中小企业活力方面发挥了巨大的作用，也与我国的经济发展形势相匹配，积极推动了我国经济和社会的发展。一系列税收法规政策的调整也从侧面反映了经济结构的调整和转型。在对税收法规政策和条款的解读方面具有极强的专业性，可是中小企业由于缺乏高素质的复合型税务人才，导致其难以有效运用财务、税务以及法律等相关知识来对国家税收法规政策的调整和变化予以专业解读，也就难以深人理解政策背景和企业自身所处行业的发展大局。特别是在对企业的资产重组、土地增值税汇算清缴、境外抵免政策等复杂涉税业务的处理过程中，往往是照搬之前案例的解决办法，缺乏有效的创新和灵活、全面的应用，再加上其对税法理解存在误差，不仅影响了税务管理的准确性和高效性，还容易诱发税务风险。一些中小企业没有对加计扣除的税收优惠政策进行全面的认识和理解，导致对其缺乏有效的利用，在无形中增加了企业的税负成木。

    (三)为了实现最大利润，导致出现税务管理的违规行为

    一些中小企业在运营管理方式和内容上面和大型企业相比有着显著的差距，导致其难以落实成木精细化管理的相关要求，因此一些企业管理者为了实现更大的经济效益挺而走险，在税务管理过程中违规操作，如隐匿收人、虚列成木、恶意避税，以此来试图达到降低企业税负压力的目的。再加上目前，税务主管部门“放管服”持续深人推进，在税收程序上面简政放权，让不少中小企业错误地认为国家现阶段的税收监管环境比较宽松，因此自身不当的税务管理措施和行为难以被稽查发现。可是随着金税三期以及增值税发票管理新系统等信息化税务管控行为和手段的全面深人开展，通过大数据稽核比对以及同行业税负的精准对标，就比较容易发现中小企业那些不当的税务管理行为，自然难以逃脱法律的制裁。