(一)“营改增”政策所带来的发票管理风险

    前文已述，我国全面实施“营改增”政策，主要目的是为了完善税制、消除企业重复征税问题，降低企业的成本费用开支。但是，在“营改增”政策的实施中，有一点不能忽视:“营改增”政策在消除重复征税、扩大企业销售份额、提高企业市场竞争力的同时，也在一定程度上容易促使企业虚开发票、套取发票。从而使企业承受着潜在的税务风险。因此，“营改增”政策实施后，我国企业需做好增值税发票管理。            

(二)“营改增”政策的实施可能使企业税负不降反增

      “营改增”政策实施前，企业缴纳营业税，大多数企业税负一般为3%、5%，个别企业税负为20% o“营改增”政策实施后，原来执行3%、5%税率的企业，可能增值税率需提升至6%、11%。虽然“营改增”后准许企业实施增值税进项税额抵扣，但是很多企业，实际可用于抵扣的往往只有购人固定资产、设备维护、租赁等，而人工成本以及边远地区的采购(边远地区的供货方往往为农户、个体户等，不具备开具增值税发票的能力)，无法真正获取增值税发票。因此，“营改增”之后，企业真正可用于抵扣的增值税进项税额依然较少。而且，倘若企业的发展已处于“成熟期”，那么企业购买机器设备、固定资产等方面的支出有限，资产新增数额不多，企业可用于抵扣的增值税进项税额会进一步缩小。因此，企业的税负可能会进一步加重。

(三)“营改增”后企业的运营存在不稳定性

      “营改增”后企业的税务风险隐患还表现在:“营改增”政策会给企业的运营带来一定的不稳定性。举例说明，通常，企业购人固定资产，往往采购金额较大。而根据“营改增”政策可知，如果企业是增值税一般纳税人，那么购买固定资产所产生的增值税进项税额可于购买时进行抵扣，税期内企业实际所缴纳的增值税额较小。反之，不购买设备等固定资产时，所缴纳的增值税额较大。如此一来，“营改增”政策的实施，对我国企业尤其是资本密集型企业而言，效益与运营都具有一定的不稳定性。