两者的目标是造成两者分离的关键区别。财务会计的工作目标是为了给报表信息使用者提供真实的企业财务经营情况、财务走向以及资产负债表实时信息，便于企业管理者作出经营决策，得出的财务报告必须是准确的，要公平地确保企业投资者和债权人以及政府了解企业实际情况。而税务会计是国家实现收入的一大要点，以国家的财政收入为目的，方便国家对市场宏观调节，提供给税务部门准确的纳税情况。            

    两者的核算依据存在差别。财务会计的核算依据是企业会计准则和会计制度，财务会计人员不考虑税法规定，严格遵守会计准则和企业会计制度，客观反映企业的经济事项。而税务会计的核算依据是国家的税收法律法规，由于税法的强制性和统一性，税务会计人员应严格计算税款并核算和申报向国家缴纳税款，保证国家足额征收税款的经济利益;同时税务会计要做到对企业税收的合理筹划，降低税负。所以，税务会计和财务会计的服务对象在一定范围内是不同的。

    两者的核算原则存在差别。财务会计的核算原则是严格根据会计准则对历史成本、重置成本、可变性净值、现值和公允价值等进行计量来保证会计信息的可靠性，必要时还会选择公允价值计量。而税务会计要严格根据法律按照历史成本进行计量。同时财务会计按照实质重于形式和谨慎性的会计原则会对有些经济事项进行合理估计，持着不高估资产和不低估负债的原则进行计量。而税务会计不考虑实质重于形式和谨慎性原则，不能进行估计，且会计计量必须准备明了有依据。

    两者的基本要素存在差别。财务会计有六大要素，其中包括资产、负债、所有者权益、收入、费用和利润，各个会计要素都反映不同的企业会计信息;而税务会计只有五大要素，分别是计税依据、应税收入、扣除费用、应税所得和应纳税额，各个要素都要严格遵照税法制度的规定。其中，财务会计的收入费用跟税务会计的应收收入和扣除费用并不是一个概念。