尽管财务集中核算为税务风险管理提供了支撑，帮助企业用全新的模式和方法规避税务风险，但企业现有的税务风险问题也不容忽视。第一，税务风险复杂多变。近年来我国财税体制改革不断深入，税法以及财税政策改革持续推进，政策环境的变化既为企业提供了发展上的指导和帮助，也要求企业更加重视税务工作的合规性。在税法的指引下，不同地区的税收政策会进行相应调整，企业所处的税务工作环境更加复杂，包括税率变动、税费申报等工作都会随之产生新的变化，企业如果不能随时了解政策法规的要求，就有可能在税务工作中出现漏洞，导致未能及时享受优惠政策，甚至面临税务风险。而且我国已进入“金税四期”，大数据稽查迅速推广，企业还有可能面对来自税务机关的调查，暴露原先在税务工作中不合规的问题，产生罚款、滞纳金等风险。                     

    第二，缺乏税务风险防范意识。当前市场经济环境日益复杂，企业所面对的竞争压力与日俱增，部分企业将主要精力用于业务发展，更多关注市场份额，对于税务风险管理缺乏足够的重视。长期以来企业对于税务工作的实施，主要是按照财务数据提交相应的纳税申报，缺乏前瞻性的风险防范意识。而“金税四期”背景下，企业面临的税务风险较多，如果风险防范意识不强，过度避税或是操作不合规，都会产生相应的风险损失。部分企业税务筹划工作相对滞后，税务筹划不合理会造成企业与税务机关之间出现争议，也会导致企业纳税、员工纳税金额的不合理，不但影响企业的税费成本，也会影响员工的切身利益。

    第三，税务风险管理制度不健全。部分企业推行财务集中核算以来，财务管理制度不断完善，对集中核算的流程、方法、标准进行了统一，明确了各单位应遵循的制度规范，但是在税务工作方面相关制度建设并不健全，不利于税务风险防范。在“以数治税”背景下，税务部门运用大数据，对企业的监控更加严格和全面，企业不合规的成本明显增加。圈而企业现有的税务风险管理工作缺乏明确的目标，以及系统的规章制度。实际上税务管理人员不仅要制定基于企业整体的税务筹划计划，还要积极配合本地税务部门，完成“金税四期”下的各项税务管理工作，及时发现企业近年来存在的潜在风险，避免税务违规的问题发生，这些都需要建立在严格的管理制度和流程基础上。

    第四，税务风险监督不到位。财务集中核算要求企业财务部门独立于其他部门，各单位都要按照统一的规范和流程配合财务部门的工作，财务人员虽然能够用标准化的方法完成日常工作，但是仍然缺乏对各单位业务实际的了解，而业务实际与各单位的采购支出、成本投入有着紧密的关联，最终也会影响到相应的税务工作。在“业财融合”不够深入的情况下，财务集中核算主要是从模式上落实，集中核算的质量难以得到充分保障，同时也会造成税务风险监督的欠缺。由于各部门信息沟通不畅，有可能出现信息传递错误或者滞后的问题，使税务工作的数据基础不准确，不利于税务部门挖掘潜在的风险问题，如费用支出不合规、优惠政策的使用不合理等。

    第五，税务工作人员综合素质有待提升。企业实行财务集中核算模式后，无论是财务管理还是税务工作都会产生深刻变革，税务风险管理更要基于标准化的流程，借助大数据技术规避风险漏洞。这就对税务管理人员的综合素质提出了更高要求，无论是对财务数据的分析，还是税务筹划的实施，都需要具备丰富的专业经验和较高的信息素养只是完成基本的税务工作，距离税务风险防范的管理要求还存在差距。