从短期看，新的会计制度的实施确实给一直使用收付实现制进行会计核算的机关行政单位的财务人员的工作带来了很大的不确定性和不小的挑战，但用可持续发展的眼光看，新政府会计制度用先进的理论首次将行政单位和事业单位的会计制度结合起来，不但简化了系统内部各单位的财务管理工作，还在另一个角度上加强了各单位的资金管理水平，对财务数据的准确性也有了更高的要求，这有利于优化行政事业单位内部资源配置，完善财务管理体制，有利于单位财务管理水平的提高和单位的进一步发展。          

    内部控制管理不仅是政府机关的一项重要控制活动，更是政府治理的重要基础，是预防和管理政府机关内部经济活动的重要一环。我国虽然颁布了有关机关内控管理规定的一系列规章制度，许多行政机关也都根据各自特点和情况建立了自己的单位内控管理制度，但是从近年来内部控制的实施来看，许多单位的实施效果并不理想，北京市税务系统也存在同样的问题。系统内各单位现有的内控管理制度和实施不完全统一，内部控制并没有发挥预想的监督作用。新政府会计制度的落实，将会对当地税务系统的内部控提出更为严格和高标准的要求，统一的会计核算模式，在客观条件上也迫使北京市税务系统制定新的配套的内控管理办法。

    在此次新政府会计制度改革的大背景下，北京市税务系统以改革为契机，整合系统内行政单位与事业单位会计制度，基于各岗位职责特征出发，推动布局完善、分工合理，履行岗位职责，加强岗位考核，完善内部奖惩相关机制，确保岗位责任制有效实施。另外，强化单位负责人作为第一责任人的作用，激发其重任意识和风险防范意识，重视系统内财务人员的思想政治工作和参与内控建设的意识，加强对内部控制的宣传，将内部控制管理贯穿于整个改革工作。从这方面讲，新政府会计制度在北京市税务系统的实施极大地推动了北京市税务系统内部控制制度的建设和有效实施。